免費中英文教程
下載免費試用版和我們的其中一個教程，以交互方式掌握Geneious的功能。
教程 - De Novo組裝拼接
了解如何執行短讀取NGS數據的重新匯編，如何處理配對結束的數據，并根據參考序列檢查裝配的質量。
了解如何為下游分析組裝和編輯色譜圖。
該模塊的目的是編輯和分析一些“原始”DNA序列數據，以確定野生動物法醫病例中生物樣本的來源。
NGS預處理，定位和從頭組裝
導入任何數據類型，解復用，修剪，過濾，匯編或映射到引用。
導入各種格式
原始數據機器直接關閉了？測序供應商的組裝結果？來自生物信息學管道的分析輸出？Geneious擁有識別這一切的能力。只需拖放即可從包括Illumina，PacBio，Nanopore，Ion Torrent和454在內的幾乎任何測序設備導入FASTQ，FASTA，BAM，VCF，GFF和其他格式。
廣泛的預處理
清潔數據對準確的下游分析至關重要。 通過利用所有必要的預處理工具，確保您的數據處于最佳狀態：
- 通過條形碼解復用/分割
- 通過閱讀質量修剪和過濾
- 修剪適配器
- 合并配對讀取
- 去重復
- 錯誤正確并正?；?/font>
- 濾除嵌合體
可靠的參考映射
不要在質量上妥協！ 與其他常用映射算法相比，獨特的Geneious Read映射器及其迭代方法可以產生出色的結果，并且可以正確對齊結構變體。 如果你需要一些不同的東西，Bowtie，TopHat和BBMap都可以在你的指尖中運行。
靈活的 De Novo 序列拼接
Geneious Assembler具有足夠的靈活性，可處理來自任何類型測序儀的數據，并且可以讀取任意長度的數據，包括來自不同測序儀的讀取和混合讀數。 對于產生圓形重疊群的獨特能力的微生物組裝尤其有益。 另外，運行MIRA，SPAdes，Tadpole（蝌蚪）或Velvet也同樣容易，MAUVE基因組比對可以幫助您進行基因組比對和整理。
使用Geneious的映射，覆蓋和變體調用
視頻簡介
應用筆記
在這項研究中，使用Geneious de novo 匯編 器從短閱讀NGS序列數據組裝兩個線粒體基因組 ，并將結果與??由Velvet，MIRA和SPAdes產生的組裝進行比較。
De Novo細菌基因組序列拼接
Illumina MiSeq數據組裝和注釋細菌基因組的工作流程。
使用Geneious從短讀數NGS數據集中重建一個完整的，循環的，注釋的葉綠體基因組。
探索Geneious中的一條管道，該管道允許從疑似感染患者身上進行的高通量宏基因組數據中準確識別和分析低濃度ZIKV。